林木遗传育种学科09级硕士生陈磊在《Gene》上发表论文

时间：2012-06-27 阅读：

林木遗传育种学科2009级硕士研究生陈磊的第三篇论文《Genome-wide identification and expression analysis of heat-responsive and novel microRNAs in Populus tomentosa》发表到SCI收录期刊《Gene》上，指导老师为张志毅教授和王延伟老师（并列通讯）。《Gene》2010年影响因子是2.266，5年平均影响因子是2.61。

毛白杨（Populus tomentosa）是我国特有的白杨派乡土树种，具有分布广、速生、材质优良及抗逆性强等特点。miRNA(microRNA)是指真核生物中长度约21个核苷酸的非编码单链RNA家族,具有负调控靶基因功能的作用；然而，鲜有有关毛白杨抗热逆境胁迫的miRNA机理研究。本研究利用Solexa第二代高通量测序技术测序后分析发现毛果杨中134个保守miRNAs成员，分属30个家族；16个新miRNAs成员, 分属14个家族。分析发现，来自15个家族的52个miRNAs在毛白杨热胁迫下表达差异显著，荧光定量分析验证这些miRNA的表达趋势和Solexa高通量测序是一致的。最后我们利用生物信息学的技术预测发现新miRNAs的109个靶基因。本研究开启了杨树miRNA抗热胁迫的探讨，为深入研究林木抗热机制打下基础。